司法書士の永鳥です。

はじめから間違って登記されていた場合ではありませんので、真正なる登記名義の回復を原因とする登記は難しいでしょう。

娘さんが借りた金銭の返済をする代わりに土地の持分で弁済する場合は、代物弁済を原因とする登記になるかも知れません。

登録免許税は、土地の固定資産評価額の２０／１０００です。

お近くの専門家に相談されることをお勧めします。